La delezione 22q13 può avere dimensioni molto variabili. In alcuni pazienti la parte di materiale mancante nella porzione terminale di cromosoma 22 è molto piccola, quindi non identificabile all’analisi del cariotipo tradizionale. Questo, fino a pochissimi anni fa, ha costituito un ostacolo nel rilevare a una prima indagine genetica la delezione 22q13.

L’analisi array-CGH (ibridazione comparativa del genoma basata su array)rappresenta uno strumento diagnostico cruciale per evidenziare la delezione 22q13. Oggi molti bambini possono ricevere una diagnosi certa di Sindrome di Phelan-McDermid a pochi mesi dalla nascita, a differenza di coloro che fino a pochi anni fa hanno potuto ricevere una corretta diagnosi solamente dopo molti anni, nel migliore dei casi da adolescenti, in altri persino in età adulta.